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Se dice que el nombre de Agnone deriva de la antigua ciudad de Aquilonia, destruida por los romanos en el año 239 a. C. Los sannitas fueron aniquilados en época de Sila.

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En 1806, con Napoleón, Molise se convirtió por ocasión primera en una provincia autónoma. Con la anexión de Larino (en la provincia de Campobasso) en 1811, tiene pero los límites que se corresponden con la región flagrante. Desde la época del Reino de Nápoles el comarca molisano estaba dividido en tres giustizierati distintos: el Condado de Molise, el Abruzzo Citra (o Citeriore) y la Capitanata.

En 847 surgieron algunos señoríos feudales: Campobasso asume una importancia económica siempre creciente llegando a ser la “capital” del Condado bajo el señorío de los De Molisio, de Venafro, de Larino, de Trivento y, los de Bojano, de Isernia y de Campomarino. Con la llegada de los normandos, en el siglo XI, los diversos condados fueron unificados y puestos bajo el control del condado de Bojano, que los normandos llamaron Comitatus Molisii.

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Históricamente, gran parte de Molise se identifica con el antiguo Samnio. A partir del siglo III a. C. sufrió la invasión de los romanos, que crearon sus propias colonias en los principales centros habitados pero existentes (Isernia y Venafro).

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Situada en el centro-sur de Italia, Molise se encuentra entre los Apeninos y el Mar Adriático, es la segunda región más pequeña y la única nacida de la división de una región.

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